姚苌杀死苻坚后，彻底成了前秦的仇人。
白雀三年（公元386）十月，苻丕兵败被杀。他的儿子苻登得知父亲的死讯后，于是发丧穿孝服守孝，三军服白。然后即皇帝位，在境内大赦，改元太初。
苻登继位后，立即对姚苌展开攻击！
他立苻坚遗像于军中，誓师以激励将士，让大家知道后秦皇帝姚苌弑主！
姚苌因屡战屡败，以为是苻坚的神灵相助，便于军中立苻坚像进行祈祷，同时把所有的过错推给他的哥哥姚襄。
姚苌真是令人佩服！因为我们人，骗骗活人，那是经常见的事情；但是，明目张胆去骗死人，那就少见了！
苻坚明明就是他自己杀了，还可以把罪过推到他哥哥身上去！
这种骗鬼的行为，真是令人佩服得五体投地！
秦主苻登升楼，看见姚苌军营中到处在拜苻坚，当下远远地对姚苌说：“为臣弑君，而立像求福，有什么用？”又大声说：“弑君贼姚苌，何不自出？我和你决战！”
姚苌不应他。
过些日子，姚苌作战还是不利！他也意识到骗鬼的行为没效果，估计是鬼都不相信他！当下一怒之下，斩苻坚画像首送给前秦。
苻登继续发兵进攻后秦，后秦屡战屡败。
姚苌为挽回败局，决定偷袭前秦！当下亲自率领三万轻骑，乘夜袭击前秦辎重地，杀了前秦毛后及苻登之子、南安王苻尚，擒名将数十人，驱掠男女五万余人而还。
苻登只得退守回去，等待时机再战姚苌！
公元391三月，苻登又亲率精兵自雍出发，进占泾水口战略要冲范氏堡，强渡渭河，进据曲牢。四月，秘密联络后秦长安外围守将苟曜为内应，抢占马头原，进逼长安。
姚苌见对方人马尚未站稳脚跟，当下用速战的法子，率领精锐出城与苻登激战竟日。
苻登终因寡不敌众，给养难继，被迫撤围，退屯于郿。
公元393七月，苻登听说姚苌染病，当下即率领兵马进逼安定。
姚苌听闻消息，带病出战，另遣将军姚熙隆率部袭击苻登行营，苻登被迫退兵。
十月，姚苌病重，回到长安。
十二月，姚苌召太尉姚旻、尚书左仆射尹纬、右仆射姚晃、将军姚大目、尚书狄伯支入宫，受遗诏辅政，并对太子姚兴说：“对待亲人要仁，对待大臣要礼，对待别人要讲信用，对待百姓要施恩，如果四者俱备，我就没什么好担忧了！”
姚苌，一生忘恩负义，残杀提拔他的苻坚，没想到临死可以说出这样一番话。而且，人之将死，其言也善。我相信，这是说出他内心想说的话。
姚晃又问攻打苻登之策。
姚苌说：“如今大业垂成，只要重用人才，还用再问什么！”不久去世，时年六十四岁。
姚兴继位之后，果然听从了父亲的话，用心经营后秦，使得后秦走向了强大。
太初九年（公元394年），苻登听说姚苌已死，十分高兴，以为灭掉后秦的机会到了，于是，尽率大军进攻后秦。
到了夏季，苻登进攻废桥以求得到水源，但被后秦将尹纬所阻，部分士兵渴死。
苻登大怒，急攻尹纬。
没想到尹纬却大败苻登，前秦兵众溃散。
苻登单骑逃返原由其弟苻广留守的雍城，他去到那里才发现苻广早已弃城，当下只得前往胡空堡，那里是太子苻崇所守，也被太子放弃，成了空城。
苻登气得直跳脚，没办法，只得继续寻找容身之地，逃到平凉，收集部众，据守马髦山。
苻登没有什么兵力了，只得向乞伏干归求救，乞伏干归命乞伏益州领兵救援。
苻登当即率兵迎接乞伏益州，哪里知道，乞伏没遇到，遇到了埋伏！
后秦军队正在寻找着苻登，没想到踏破铁鞋无觅处，得来全不费功夫！当场把苻登给生擒并处决了，苻登时年五十二岁，至此，前秦覆灭。
姚兴灭了前秦后，跟着灭了乞伏鲜卑人建立的西秦，再接着灭了后凉，逼降南凉、北凉和西凉，占据西方重镇姑臧。
这样，后秦的疆域“南至汉川，东逾汝颍，西控西河，北守上郡”，成为十六国后期国力仅次于后燕的强盛王朝。
老天要是让后秦这么发展下去的话，说不定一个前秦一样统一北方的国家就要诞生！
可惜，老天不给后秦这个运气，因为姚兴病了，很快要死了！他的内部开始乱了！
这个乱是由皇子姚弼和皇太子姚泓争夺皇位引起的。
在姚兴的诸子中，皇长子姚泓并不受宠。
这主要因为姚泓性格宽和、才能平庸，且又体弱多病。早在姚泓立为太子时，姚兴对他就颇为犹豫。
姚兴喜爱的是皇子姚弼，认为他是比较理想的继承人，因此平素格外宠信。
这也导致了姚弼逐渐滋生夺嫡的欲望。
他原以雍州刺史之职，镇守安定，经过买通姚兴的左右，弘始十三年（公元411年）调入朝廷，任尚书令、侍中等职务。
姚弼取得相权后，努力结纳党羽，积极制造舆论，企图击败皇太子。但大多数朝臣对他比较反感。
为了使别人不敢反对他，姚弼给倾向于姚泓的大臣姚文宗罗织了许多罪名，激怒父亲将姚文宗杀死。
他还苦心积虑地在姚兴身边安插亲信，广树爪牙，逐渐控制一些中枢机要部门。
姚兴对姚弼的活动，采取纵容的态度。有人提醒姚兴注意事态发展的危险后果，他假装糊涂，不予理睬。
对于姚弼的夺嫡阴谋，皇太子姚泓已有戒备。
这次姚兴生病，姚泓一面亲自到内宫侍疾，一面在皇宫内安排下重兵，以防不测。许多忠于太子的要臣分别统领禁军，宿卫大内。
姚泓并非过虑，姚弼在府第里已埋伏下数千甲士，准备一旦姚兴去世，立即武力夺权。其他皇子也不甘示弱，在京城的皇子姚裕给镇守蒲陂的哥哥姚懿送去密信，要他串连在外典管重兵的诸皇子，以讨伐姚弼的名义，举兵内向。姚懿得讯，立即动员军队，赦免囚徒，建牙誓众，开赴长安。姚洸、姚谌等人也分别起兵于洛阳、雍县。
一时剑拔弩张、烽烟滚滚，大有内战一触即发之势。幸亏姚兴大病不死，紧张的形势才得以缓和下来。姚兴虽对姚弼恃宠不虔，阻兵怀贰的罪行有所认识，但仍偏爱姚弼的才气，不忍加刑，只是免去了姚弼的尚书令职务。姚懿等人罢兵还镇后，专程进京面谏姚兴，要求惩办姚弼。
姚兴把他们搪塞了过去。
在进京面谏的皇子中，以姚宣抨击姚弼的措词最为激烈，姚弼十分痛恨他。第二年三月，姚弼诬陷姚宣，姚兴信以为真，派人到杏城将姚宣逮捕下狱。赫连勃勃乘机攻打杏城，后秦守军临战易帅，战斗力大减，遂兵败城陷。
这时，姚兴已完全恢复了对姚弼的信任，并将三万大军交给他，由他负责镇守秦州。臣下尹昭反对姚弼掌握强兵，批评姚兴为后秦制造隐患，但姚兴不以为然。
不久，姚兴再度患病。
姚弼故伎重演，称疾不朝，又开始在府第聚兵。
姚兴气得发昏，在处决姚弼的几个党羽之后，召集群臣商讨逮捕和惩治姚弼的办法。然而姚兴只是一时之怒，到火气一消，爱子心切，故数日议而不决。消息走漏，姚弼的党羽磨刀霍霍，十分活跃。
姚兴害怕兵变，被迫下令逮捕姚弼，但又暗示姚泓出面来说情，并以此为词将姚弼赦免。
弘始十八年（416年）二月，姚兴病势转重，自知不久人世，遂下令太子监国。
姚弼的党羽在谋杀姚泓和劫持姚兴的计划未逞后，开始策划入宫作乱。
姚兴终于下令收缴姚弼的武装，逮捕姚弼。姚弼的死党姚洸误信姚兴已死的谣传，带兵攻打端门，皇城内外展开了激烈的战斗。
姚兴勉强支撑病体，被人扶到殿前，宣布处死姚弼。乱军失去斗志，溃散而去。事变平息的第二天，姚兴病发去世，终年五十一岁。
太子姚泓虽然继位，但后秦宗室通过骨肉相残，自相削弱了不少。