吴三桂兵进永昌之时，清军统帅、信郡王多尼也率满汉大军进至昆明，于城外安营扎寨。左路清军线国安部也突破广西府城，定于26日前来昆明会师。
抵达昆明后，多尼便感到头疼，让他头疼的是入滇各部的粮草运输出现问题。
清军进入云南后，李定国便令各部明军实行坚壁清野，使得清军无法在云南就地补充粮草，加上明军突然退去，清军在没有抵抗的情况下长驱直入，结果固然占领了云南大部地区，可在钱粮方面却是所获有限，后勤补给线也随着清军推进过快出现问题，设在贵阳的粮草大营已经不能按照原先的计划定期向各部清军转运粮草。
另外，明军主力部队虽退去，可云南及贵州境内仍有不少明军杂牌和土司武装反抗清军，他们的存在直接威胁到了清军粮道，已致多尼不得不令平郡王罗可驿带兵北返，以确保粮道安全。
昆明这场大火让多尼也是措手不及，大火不仅焚毁了李定国屯于城中的数百万石粮食，更让城中百姓的存粮也毁于一旦，使得清军想从百姓手中搜粮都不得。
倘若永历朝廷随着昆明城一起覆没，那么清军的粮草问题也不算多大，可现在永历朝廷跑到了滇西，李定国、白文选等明军主力也退到了滇西南一带阻击清军。永历朝廷一日不亡，这场战争便一日不能结束。而战争一日不能结束，大军所需钱粮就是个无底洞，单靠贵阳粮草输送，显然是无法支撑入滇清军长时间和明军对峙的。
一方面，多尼将速战速决的希望放在了兵进永昌的吴三桂身上；另一方面，他让洪承畴带着固山额真宜尔德、户部章京卓罗、提督张勇到已占领各府州县视察，期望能够通过搜刮这些地方的粮食解决大军粮草不足的问题。
结果让多尼很失望，洪承畴回来奏报，说各府、州、县的钱粮他已叫府厅官员详细盘点，可就算把这些地方的钱粮全运到昆明来，也不够大军开支半月。现云南境内只有征南将军赵布泰驻扎的宜良县城略有粮米所得，其余各处都是坐吃山空，全靠贵州粮草输送。
多尼年轻，也是第一次出任大军统帅，缺少处置经验，他问洪承畴有什么办法可以缓解粮草不济，洪承畴却摇头说没有。巧妇难为无米之炊，洪承畴其实很想告诉多尼，目前这个局面其实是清军自己造成的，要不是清军各部在云南境内烧杀抢掠，云南百姓也不会视清兵为仇寇，那些土司也不会仍旧站在明朝那边不肯相助大清。若一开始清军便对云南推行剿抚并重的策略，对那些地方实力派和土司们加以拉拢，也不会落到如今这种地步。
多尼有些失望，洪承畴明确告诉他，想要继续支撑这场战事，贵州的粮食便是清军的生命线。而贵州的粮食又是清廷从东南调来的漕米，所以西南战事一日不结束，东南漕米便一日不能调拨京师，时间久了，京师定然有怨言。
洪承畴的提醒让多尼有些警醒，六天前皇帝派来的使者除了恭贺大将军进展顺利外，也提到了皇帝希望大将军尽快结束西南战事，从而可以抽出兵马解决广东的太平军，另外东南方面也需回兵，情报显示金厦的郑氏八月出兵北上并不是攻打浙江，而是想从长江直驱南京城下。虽说郑氏船队于洋山海面遭遇飓风损失惨重，但郑氏父子经营数十年，富可敌国，这场飓风造成的损失并未动摇郑氏根本，因此郑氏很可能会继续北上攻打南京。所以为防万一，皇帝希望大将军可以早点结束西南战事。
多尼何尝不想快点班师回京，可永历朝廷还没覆没，他想班师也不得。现在唯一的希望就是吴三桂不负重望，能把朱由榔擒杀在永昌了。
苦闷时，贵阳却传来八百里急报。
急报是广西巡抚陈维新通过贵阳的军驿发来的，他言告广东太平军已入广西，梧州、浔州、柳州等重镇皆被太平军占领。鉴于太平军兵马强大，桂林孤城难守，陈维新为保存官兵实力，便率部退入贵州都匀。信中，陈维新称入桂的太平军兵力有十数万之众，不仅有水师，还有骑兵，寇首周士相麾下更有一支铁甲兵，遇人斩人，遇马斩马，颇是悍勇。
陈维新其实一开始并不是想退入贵州，而是想从南丹直接退入云南和线国安会合的，可攻占了桂林的太平军第五镇一直紧咬他不放，若是按原计划退入云南和线国安会合，陈维新担心自己可能撑不下去，所以在总兵徐天佑等人的劝说下，他领着残部退到了贵州境内。追击的太平军发现陈维新退入贵州境内后，不知为何竟没有再追下去。陈维新对此的判断是太平军的目的就是入云南勤王，所以他们不愿意进入贵州耽搁时间。
“广东蛮子进展也太快了些吧？”
多尼年轻的脸庞上浮现一丝讶色，有济度的前车之鉴在，他自然不怀疑广东那支明军的战斗力，也不会轻视，但是对方的推进速度仍然超出了他的想象。
半个月前多尼接到赵布泰的奏报说太平军已经进入广西并占领梧州，巡抚陈维新派人八百里急报请求线国安领兵回援，但赵布泰却认为广西不比云南，太平军攻打广西的目的就是为了到云南救他们的朝廷，所以谁主谁次显然很清楚。大清军的用兵方向只能是云南的永历朝廷，广西那边虽梧州已失，但尚有柳州、浔州、桂林、南宁等大城横在太平军入滇路上，可令这些地方的守军坚守以迟滞太平军的脚步，这样等到他们拿下广西，打通和云南的通道时，云南这边的大局早已定了。没有了朝廷，没有了大义，太平军再是能打也终将分崩离析。
多尼采纳了赵布泰的建议，他和洪承畴商量的结果是太平军进展再快，也须至少三个月时间方能占领广西，可现在，太平军只用了一个月的时间就占领了广西数座重镇，速度之快，多尼感到很是心惊。