无论如何，政局就这样勉强平息了下来。
而不久之后，已成为粒子意识的初雨又在主级世界找到了泽勒娜女爵的意识残骸。由于体质的特殊性，泽勒娜女爵拥有比一般人更强的精神力，因此在遭到初源意识侵蚀的时候，残留的部分意识勉强藏身到了主级世界。
经过与梅菲斯特公爵的商讨，众人决定不公开初源的罪行。泽勒娜女爵仅仅表示自己是遭到了皇帝陛下的囚禁，因为她不同意突然对夜鹫开战，惹怒了陛下，所以才暂时被夺去了自由。梅菲斯特公爵也曾想过要公开更多的真相，让初源受到更重的谴责，但想到初雨一定不希望看到这种事，因此也就没有那样做。
政局平息以后，另有一件事情需要解决，那就是进化键的淘汰工作。皇族身上的进化键是由初源制作的，进化键给予了皇族超越生物法则的寿命和能力，以粒子意识制定的规则，这种东西不能存在于世。
而由于之前的皇族失控发狂事件，被认定成为皇帝陛下私自研究的病毒泄露，梅菲斯特公爵也就顺势将进化键描述成为危险的感染源。只要携带进化键，就随时可能再次遭到感染，这一说法令皇族社会产生了惶恐，众多皇族纷纷不愿再携带这种危险的东西，转而想要利用夜鹫的药物维持寿命。
然而，药物会带来十分严重的副作用，况且同样超越了粒子意识的法则，终究必须与进化键一同消失在世界上。已经习惯了皇族身份人们不能接受自己重新变回平民，眼看帝国又要引发一场新的暴动。
梅菲斯特公爵经过深思熟虑之后，提出了一项新的科研方案。在失去进化键以后，人类需要寻找其他的变异方向，得到新的进化形态，具体的变异方向有两个，机械向或者兽化向。
由珈蓝星域的崔西伯爵所执掌的机械人偶技术已经相当成熟，而水晶星域的艾斐逊伯爵也长期专注于兽化研究，对帝国而言这是两项比较成熟的技术。梅菲斯特公爵希望从这两个方面着手，制造可供替换的强壮人类身体，从而使得帝国的子民以新的方式获得寿命和力量。
如果这一方案可以成功，就可以扭转目前皇族与平民的畸形关系，所有人都可以从进化键之中摆脱出来，而平民也再无需付出生命去完成粒子能量的征税任务。
方案的推行艰难地进行着，皇族们已经习惯了使用自己的身体，对于需要改造身体来延长寿命的方法有些不能接受。但随着时间的推移，情况逐渐出现了变化，由于初源的力量衰弱，连带着进化键的力量也开始衰弱，坚持不肯服用夜鹫的药物，也不肯接受改造方案的一批传统皇族们，快速出现了衰老的症状，很快就因为全身器官的衰竭而死去了。
没有了进化键，夜鹫又开始逐渐停止供应药物，如果还想要长寿和强壮的话，似乎也别无选择。梅菲斯特公爵将械化和兽化的科研机构分别设置在珈蓝星域和水晶星域，愿意接受方案的皇族们分别向两个星域逐渐迁移，帝国的人员分布格局开始出现了变化。
而经过数月的推行，第一批械化与兽化皇族诞生。新生的五代种皇族拥有了崭新的身体，而且经过特殊强化之后不用再担心体内的粒子能量失衡。皇族不再受到那些痛苦的约束，他们可以自由地与平民做一样的事情了。
两个阶层的同化，也使得皇族特权开始不那么明显。梅菲斯特公爵并不限制变异者的身份阶级，只要是符合条件的人，就算是平民也同样可以参与方案。就这样，阶层之间的差距逐渐消弭了，平民得以从繁重的税收和孱弱的身体之中彻底解放出来。
由初源所一手导致的帝国矛盾，通过梅菲斯特公爵的方案得到了逐渐的改善。虽然由此也导致各地爆发了皇族和平民之间的对立，但内战的规模基本还在可控范围之内。
经过长年的压抑生活，皇族已经习惯了清心寡欲，意志远不如平民那么坚定强硬。在渴求平等生活的平民面前，皇族几乎有些招架不住。曾经由皇族成员所组成的精锐军队星耀巡航军，在梅菲斯特公爵的授意下也并不介入内战，只负责协调民众之间的矛盾。多重改革下，皇族的地位和势力迅速被削弱，平民在星耀帝国中得到了极大的话语权。
数年之后，皇族爵位几乎已经名存实亡。梅菲斯特公爵顺应大势开始取消爵位封号，凡是帝国的国民都一视同仁。而帝国体制也因为阶级矛盾削弱而逐渐瓦解，以械化人和兽化人为主的两大星域各自为政，几乎已经摆脱了帝国王都的控制。
此时，除了王都之外，帝国呈现出械化，兽化和普通人类三大种族抗衡。三者彼此之间友好往来，保持距离，各自拥有着不同的习俗和生活方式。至此，星曜帝国已经名存实亡，在一个秋日的黄昏，梅菲斯特公爵正式发表声明，决定完全废除帝国爵位封号，同时宣布星曜帝国正式解体。
帝国的历史结束了，初源一手建立的王国，最后还是终结在了他的宿敌手中。解体后的星域重新协商谈判，重组成为星盟，星盟各大成员星域各自为政，互不干涉，而曾经的王都则成为协调星域之间利益矛盾的星盟议会。
星盟议会成员由三大种族成员共同担当，亚颂梅菲斯特被选举为第一任议长。他解散了星耀巡航军，将他们分配至各大星域，转职成为守备军队。凛都少将留在了星盟议会，继续为曾经的公爵阁下贡献一份力量，而日曜罗睺，月曜计都，血曜梵天和星曜圣灵四部星曜级智能机甲，成为了星盟议会的铜墙铁壁，它们带着初雨的期待，忠诚地守卫着这来之不易的和平。
或许有一天，又会有新的敌人像初源那样摧毁这份和平。但至少现在，亚颂的努力没有白费，他从粒子意识的手中救回了这个世界，终于没有让它彻底毁灭。
***
十七年后。
珈蓝星域械化研究所，曜仪在培养皿中慢慢睁开眼睛。
亚颂在培养皿外看着他：“感觉怎样？经过数十次优化以后的身体，希望这次能让你满意。”
护理人员将曜仪搀扶下来，他勉强站住，疲惫地喘了一口气，又在一旁的轮椅上慢慢坐下。他说：“运动神经的连接似乎还有一些迟滞，多加锻炼的话应该会改善的。”
亚颂有些歉意：“真的很抱歉，你为械化技术做了这么多贡献，我却一直都没法让你恢复健康。”
当年星曜帝国还存在的时候，曜仪在初代种叛逃事件中遭到声波能量武器攻击受伤，双腿完全失去知觉。近年来械化身体技术突飞猛进，凭借实验室可以制造出与原型别无二样的人造身体，亚颂希望得以利用这项技术让曜仪恢复健康，但由于之前曜仪的伤势已经波及到脑神经，要完全康复是相当困难的。
曜仪对此倒是相当宽容：“没关系，这本来就不是你的义务，协助研究也是我自愿的。械化身体至少让我摆脱了衰老的困境，我有无数的时间可以等待的。”
他说着滑动轮椅：“去外面走走吧，我想和你聊聊。”
两人离开实验室，室外，是一处生机盎然的天然花园，空气里带着阳光和鲜花的香气。曜仪停留在人工湖的面前，有些感慨地说：“想不到有一天，我还能在阳光下欣赏这番美景。当年离开星曜帝国以后，夜鹫的秘密基地就成为了我的家。那时候还以为，我一定会在阴冷潮湿的地下过一辈子了。”
亚颂笑笑：“这都是多亏了初雨，没有他，就不会有现在的星盟。”
曜仪也笑了，说：“你陷得太深了，总是初雨，初雨的。粒子意识只是为我们指明了未来的方向，真正创造这一切的是你啊。”
说着，他低声问：“……那么，初雨是不是快要回来了？”
亚颂点了点头：“他在梦里对我说，星盟的政局趋于稳定，人类进化变异的方向也大致正确。如果其他的次级世界也平安无事的话，他可以回来一段时间。”
曜仪远眺着天空：“时光飞逝，你居然已经等了他十七年。”
亚颂笑笑：“我们常在梦中见面，我并不感到孤独。倒是你自己，初源至今还在逃避你吗？”
十七年前混乱的局面平息之后，初雨修复了初源严重衰弱的精神力量，让他可以回到星曜帝国。他原本的*早就消亡了，但可以使用械化身体继续生活，初雨愿意对他不计前嫌。
但是初源不愿意，他没有走。
高傲的自尊心，让他不愿意去面对自己一手创造却又被自己毁灭了的世界。他留在了初雨的身边，成为他意识触须的一部分，协助他一同监视其他的次级世界。在其他的世界里，或许也有跟他一样野心勃勃的人，初雨需要未雨绸缪，将这些微小的火苗完全熄灭。
这个是一个让大家都非常意外的选择，初源曾经是那么的憎恨粒子意识，想要代替他成为世界的主宰。但他最终却成为了粒子意识的协力者，为它贡献出了自己的一份力量。
也许，在他的心底还有一丝不甘，他还在等待着东山再起的机会。
曜仪叹了口气：“早在当初我们分道扬镳的时候，我就已经阻止不了他了。这份责任应该在我，是我没有意识到他内心的真正想法，太轻易就让初雨诞生在了这个世界上。”
亚颂摇了摇头：“一切都过去了，只要现在一切都能归于平静，你就不必太过自责。”
这时，有人从远处走来，是凛都少将。帝国解体之后，星曜巡航军改制重组，分散到星盟的各个成员星域担任守备工作，凛都则留在了原王都星域保护星盟议会，是星曜巡航军之中少数保留原有军衔的旧皇族。
他走到亚颂身边，十分礼貌地说：“打扰二位了，星盟议会有一些工作需要与梅菲斯特议长阁下商讨，接您的车已经在研究所外面等着了。”
亚颂点了点头，对曜仪说：“我得失陪了。”
曜仪笑笑：“辛苦你了，听说雷溪现在也是公务繁忙，他很难驯服，还好吗？”
亚颂说：“他正在适应智能机甲的操作方法，尤谢科卿在协助他。”
一旁的凛都少将微微低下头。
曜仪对他笑笑：“如果他有什么做的不好的地方，尽管批评他就是了，不必心软。”
凛都少将微微一笑：“会的，我一直都是这么做的。”
气氛一时有点微妙，三人互相沉默了一会儿，亚颂突然笑起来：“那我们就赶快走吧，时间拖得太久，议会那边会不高兴的。”